信帆生物:miRNA與癌癥:了解它們之間的關聯
更新時間:2016-05-16 點擊次數:1052次在腫瘤發生的經典模型中,癌癥通過慢慢積累突變、放任細胞增長而發生。許多這樣的突變影響關鍵的調控蛋白,如原癌基因和抑癌基因。不過,非編碼RNA基因的突變也同樣有害,尤其是microRNA。
microRNA(miRNA)是一類22個核苷酸的調控轉錄本。它們與mRNA靶點相結合,或抑制其翻譯,或誘導其降解。因此,它們也像轉錄因子一樣,影響基因表達。
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根據Brigham婦女醫院的Sean Lawler在2014年發表的綜述,*個將miRNA與癌癥相關聯的線索發表于2002年,研究發現慢性淋巴細胞白血病中的miR-15和miR-16缺失,導致它們的靶點BCL2上調。自那時起,人們開始研究miRNA在癌癥中的作用。
如今,研究人員已經鑒定出數千個miRNA,并積極研究它們的生物學,以及它們是否能作為疾病、預后或治療反應的生物標志物。各種各樣的工具也應運而生,協助研究人員更好地了解miRNA的作用。
模擬物和抑制劑
大多數的miRNA工具分成兩大類:miRNA操控和miRNA表達分析。
操控這一類主要是miRNA模擬物、抑制劑和表達構建體。模擬物和抑制劑是合成分子,顧名思義,模擬miRNA的表達或阻斷它們的調控能力。表達構建體讓研究人員能通過一個或多個miRNA基因的轉錄,在靶細胞上施加影響。
Dharmacon(現屬于GE Healthcare)提供模擬物和抑制劑;這些可通過轉染導入細胞。據Dharmacon研發主管Melissa Kelley介紹,研究人員可以在相同條件下、不同的孔中使用模擬物和抑制劑,尋找相反的表型,以便對結果更加自信。
Dharmacon也提供慢病毒表達的模擬物,稱為shMIMIC lentiviral microRNA,用于那些無法輕易轉染或需要活性的細胞。據Kelley介紹,shMIMIC lentiviral microRNA是短的發夾結構,在細胞中表達并被處理成成熟的miRNA,以驗證表達特定的miRNA是否能讓細胞恢復正常生長。
表達工具
與所有RNA一樣,研究人員也可以利用新一代測序(NGS)、芯片、qPCR和原位雜交等方法來定量miRNA。
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