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原 理 
蛋白質分子在溶液中由于其末端氨基、末端羧基及側鏈的游離基團而成為帶電顆粒，并可在電場內移動，其移動方向取決于蛋白質分子所帶靜電荷。不同蛋白質分子根據其氨基酸組成及所在溶液的pH值，攜帶的靜電荷不盡相同，致使它們在電場中的遷移率各異，從而達到分理的目的。
電泳原理示意圖

在蛋白質組學中對電泳的分類

一維電泳(one dimensional gel electrophoresis, 1DE)，現在普遍采用垂直板聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）
二維電泳(two-dimensional gel electrophoresis, 2DE)，又稱雙向電泳

一維電泳
現在普遍采用聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE），包括非變性電泳(native PAGE)和SDS-PAGE兩種，前者主要是在分離蛋白復合物時經常用到。后者是在凝膠與緩沖系統中加入陰離子表面活性劑十二烷基硫酸鈉（SDS），蛋白質分子被大量SDS陰離子包裹，消除了它們間原來攜帶的電荷差別，因而其遷移率僅反映蛋白質分子大小，故廣泛用于蛋白質分子量的測定。
凝膠濃度和蛋白質分離范圍

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